[연구] Simulation 제작(2)

네트워크를 통한 구조 결정

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• 노드와 피드백의 갯수가 네트워크를 따름
• NetworkX 패키지의 graph generators 사용
  • barabasi_albert_graph
    • 스케일-프리 네트워크 생성
    • 기존 노드들의 차수에 비례하여 새로운 노드가 연결될 확률 증가 ⟶ ‘허브’ 노드 형성
  • powerlaw_cluster_graph
    • Power-law 분포를 따르는 노드들이 클러스터링 된 구조를 갖는 네트워크를 형성
    • p: 클러스터링 확률

sketch

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1. 네트워크 생성
2. 유전자 발현 시뮬레이션
3. 저장

• Graph generator로는 가장 강한 확산을 보이는 powerlaw_cluster_graph나, 허브 중심의 확산이 일어나는 extended_barabasi_albert_graph가 적합해 보인다

• sketch.ipynb